Журнал учрежден Государственной публичной научно-технической библиотекой Сибирского отделения Российской академии наук (СО РАН) и утвержден 23.09.2004 г. Президиум СО РАН. Его первым главным редактором был д.т.н., проф. Б.С. Елепов. В первый год (2005) журнал издал 2 выпуска, во все последующие – стабильно по 4 выпуска.
В 2010 г. журнал «Библиосфера» был включен в Перечень Высшей аттестационной комисси (ВАК) Минобрнауки России для опубликования основных научных результатов диссертаций на соискание ученых степеней кандидата и доктора наук. В сентябре 2015 г. он вошел в новый Перечень ведущих рецензируемых научных журналов и изданий, рекомендуемых ВАК по группе научных специальностей 05.25.03 и 07.00.00, который действовал с 01.12.2015.
В соответствии с решением ВАК от 25 октября 2017 года № 2-пл/2 с 1 января 2018 года журнал «Библиосфера» включен в Перечень ВАК только по специальности 07.00.00 – исторические науки и археология.
Распоряжением Минобрнауки от 26 марта 2019 г. журнал исключен из Перечня ВАК по группе научных специальностей 07.00.00.
Тем не менее Библиосфера стала первым и остается единственным за Уралом профильным научным журналом по проблемам библиотековедения, библиографоведения и книговедения, который отражает на своих страницах результаты научной деятельности сформировавшихся здесь научных школ; где публикуются молодые авторы, даются обзоры по самым актуальным направлениям теории и практической деятельности отечественных и зарубежных библиотек.
Тесная связь журнала с ведущими профессорами и доцентами институтов культуры, и прежде всего – Санкт-Петербургского, позволила вести в журнале раздел «Методология НИР», благодаря чему журнал стал в России ведущим научным периодическим изданием, в котором регулярно публикуются статьи по новым методам научных исследований, обсуждаются проблемы методологической базы диссертационных работ.
Журнал стал изданием, в котором публикуются авторы (аспиранты, докторанты, известные ученые) из многих регионов России: Москвы, С-Петербурга, Казани, Белгорода, Екатеринбурга, Н-Новгорода, Челябинска, Омска, Томска, Кемерово, Красноярска, Улан-Удэ, Владивостока, Хабаровска и др. Здесь публикуются коллеги из зарубежных стран.
В Сибири и на Дальнем Востоке находится 7 вузов, которые готовят специалистов для современной библиотеки, в них работает большое количество профессоров и доцентов, подрастает научная молодежь. (см. также Лаврик О.Л. Новый журнал по библиотековедению, книговедению и информатике «Библиосфера» // Электронные ресурсы региона: проблемы создания и взаимоиспользования Региональная научно-практическая конференция "Электронные ресурсы региона: проблемы создания и взаимоиспользования". ГПНТБ СО РАН. 2005. С. 271-275. https://elibrary.ru/item.asp?id=29378917).
С самого начала издания журнала на сайте учредителя ведется его страница. В 2019 г. появился его собственный сайт.
С 2016 г. всем статьям в журнале присваивается DOI. В том же году появилась возможность подавать статью через сайт. С 2017 г. журнал стал размещать на сайте материалы к опубликованным статьям, которые содержат развернутые исходные исследовательские данные, не вошедшие в основной текст статьи.
В середине 2019 г. было принято решение об изменении структуры управления журналом. Теперь он имеет только редакционную коллегию, в составе которой 11 зарубежных ученых, 15 российских специалистов и 9 ведущих сотрудников ГПНТБ СО РАН.
